CWL実行時に、パラメータとしてファイルを渡したときの location や path

• location は、実行者側のファイルシステムのパスになる
• pathは、cwl環境内でのパスになる。

以下は、ファイルを渡したときの、cwltoolが出力したもの。
いくつかのプロパティがどのようになっているかも確認できる確認できる

• location
• path
• basename
• nameroot
• nameext
• dirname

プロパティの詳しい内容については、
このなかの、Fieldsのところを読むと良い

01 "use strict";
02 var inputs = {
03     "file": {
04         "class": "File",
05         "location": "file:///home/manabu/work/cwl/ref/refGene.bed",
06         "size": 12622028,
07         "basename": "refGene.bed",
08         "nameroot": "refGene",
09         "nameext": ".bed",
10         "path": "/var/lib/cwl/stg82bad4cb-fb9a-4606-842e-99df90f8d021/refGene.bed",
11         "dirname": "/var/lib/cwl/stg82bad4cb-fb9a-4606-842e-99df90f8d021"
12     },
13     "renamed_name": "$(inputs.ref.path)"
14 };
15 var self = null;
16 var runtime = {
17     "cores": 1,
18     "ram": 1024,
19     "tmpdirSize": 1024,
20     "outdirSize": 1024,
21     "tmpdir": "/tmp",
22     "outdir": "/GnBghe"
23 };