URPの場合は以下のようにRendererFeatureにアクセスできます。
var pipeline = ((UniversalRenderPipelineAsset)GraphicsSettings.renderPipelineAsset);
var propertyInfo = pipeline.GetType().GetField("m_RendererDataList", BindingFlags.Instance | BindingFlags.NonPublic);
var scriptableRendererData = ((ScriptableRendererData[])propertyInfo.GetValue(pipeline))[0];
var renderObjects = (RenderObjects)scriptableRendererData.rendererFeatures[index];
renderObjects.settings.depthCompareFunction = CompareFunction.Greater;
scriptableRendererData.SetDirty();
値を変更した場合、ScriptableRendererData.SetDirty() を呼び出すことで変更が反映されます。
自作RendererFeatureを実装している場合は以下のようにアクセスできます。
var myRendererFeature = scriptableRendererData.rendererFeatures.OfType<MyRendererFeature>().FirstOrDefault();
Unity 2020.1.17f1
Universal RP 8.3.1