Cydia等のインストーラでインストールすればdebファイルを意識する必要がありませんが、気に入ったAppをバックアップしたい場合はdebファイルを保存しておけば安心なこともあると思います。

インストーラがリポジトリからdebファイルをダウロードして、インストールが終わってもリスプリングするまでならdebファイルが削除されずに残ってるので、リスプリングする前に別な場所へ保存しとくという方法もありました。

あるJBTweakのdebファイルを探していたら、素敵な記事を見つけたのでメモを残すことにしました。
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