はじめに

論文を書くためには、多くの論文を読み、参照しつつ執筆する必要がありますが、その工程の生産性を向上させるツール、Papers 3 と Scrivenerを紹介します。
いずれのツールも Mac/PC版とiOS版があり、Dropbox経由で同期できますので、いつでもどこでも仕事が捗ります。

Papers 3

こちらのブログで詳しく紹介されています。
http://lifehacking.jp/2013/12/papers3/

iPad版で論文を読みながらハイライト、メモができ、アノテーションも含めて、Mac版と同期できます。

書籍が出てます。
「考えながら書く人のためのScrivener入門小説・論文・レポート、長文を書きたい人へ」
https://www.amazon.co.jp/Scrivener-ebook/dp/B01CZCM53A/

一言で言うと、高機能なアウトラインプロセッサーです。細切れのメモを組み合わせ、並べ替え、推敲するために使います。ScrivenerもMac, iOS版があり同期できます。