縦持ちデータ(ロング型)を横持ちデータ(ワイド型)に変換したい

医療関連の企業に勤める友人から、大量のロング型データをワイド型データに変換したいって相談されました。
そちらの業界では、患者などのデータをワイド型で表すことが多いという。
そこで、変換ツールをpython作ったので記事にしました。

---

以下、変換イメージ

変換前

ID,data,item,
0,100,BPS,
0,200,LDL,
1,20,YBY,
2,XXX,YYY,
2,AAA,BBB,

変換後

ID　  YBY  BBB  BPS     LDL  YYY                              
0     N/A  N/A  100  　 200  N/A
1      20  N/A  N/A     N/A  N/A
2     N/A  AAA  N/A     N/A  XXX

---

そこで、pandasを利用してツールを作成しました。
作成したツールは以下になります。

import pandas as pd
import csv

csv_file = open("sample.csv", "r",
                encoding="ms932", errors="", newline="")
f = csv.reader(csv_file, delimiter=",", doublequote=True,
               lineterminator="\r\n", quotechar='"', skipinitialspace=True)
columns = next(f)
data = []

for row in f:
    data.append(row)

df = pd.DataFrame(data, columns=columns)
df_t = df.pivot_table(values=[columns[1]], index=[columns[0]], columns=[
                      columns[2]], aggfunc='sum', fill_value='N/A')
df_t.to_excel('out.xlsx', index=True)

sample.csvを読み取って、ワイド型データに変換し、Excelに出力します。
前提として、csvの列は３つになっています。
IDごとに行を作成し、itemの項目が多いほど列が追加されます。そして、各値にdataが設定されます。もし、dataがなければN/Aが設定されます。

出力結果

CSVをロング型からワイド型に変換するしたい方がいましたら、こちらの実装を参考にしてください。
以下のGithubにもソースは載せています。
https://github.com/kurihiro0119/transform_wide_long