なかなかドンピシャなコードがweb上で見つからなかったので記録用に掲載。

Sub MultiSheetFilter_Delete_FillterFalse()
    Dim ws As Worksheet
    
    For Each ws In ThisWorkbook.Worksheets
    
    Dim targetRange As Range
    
        ws.Range("A1", "XFD1048576").AutoFilter Field:=2, Criteria1:="特定の値"
    
    With ws.Range("A1").CurrentRegion

        Set targetRange = .Offset(1, 0).Resize(Rows.Count - 1).SpecialCells(xlCellTypeVisible)
        
        targetRange.Delete shift:=xlUp
        
        ws.AutoFilterMode = False
    
    End With

    Next ws
End Sub

おそらくもっとシンプルに書けるのでしょうけど。。

ちなみに、

Set targetRange = .Offset(1, 0).Resize(Rows.Count - 1).SpecialCells(xlCellTypeVisible)

の部分の

Resize(Rows.Count - 1)

は、

Resize(.Rows.Count - 1)

とするweb記事が多かったのですが、下記環境ではエラーになったので補足します。

macOS, office365