pigzでプログレスバーを表示させる

pvコマンドを使えば出せる。

pvコマンドのインストール

sudo apt install pv

圧縮

pv hoge.fastq | pigz -p 8 > hoge.fastq.gz

備考

ディスクの書き込み速度をmonitorで見ていると、-p 8 でもせいぜい10MiB/s 程度のようある。
おおざっぱに、HDDの書き込み速度が 60〜120 MiB/s 程度、SSDの書き込み速度が 400〜500 MiB/s 程度だとすると、HDDを使っている場合でも -p 16 としても書き込み速度が律速になることはなく、安心してプロセスの数を増やせる気がする。