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(Rの)環境問題について その6。

Last updated at Posted at 2012-04-06

http://qiita.com/items/325bdf48f4f4885a86f1
http://qiita.com/items/35184390984975ec7c6d
http://qiita.com/items/7fdb523a05a2e0b12f35
http://qiita.com/items/1cb4a7a05b026a0cf2bb
http://qiita.com/items/a0a926c9e01aebb6261a の続き。

promiseは後回しにしておいて、名前空間と環境の話をします。

Rはパッケージシステムを用いていて、それぞれのパッケージはそれぞれの名前空間を必ず持っています(確かR 2.14.0 以降)。この話は、パッケージを作成する場合、または既存のパッケージの中の関数をハックしたい場合以外はあんまり役に立ちません。

パッケージ関連の環境のサーチパスと、関数呼び出しでの環境検索は、根っこは同じなんですが、分けて考えたほうがはるかに分かりやすいです。

関数にまつわる3つの環境

大事な話なのでもう一度書いておきます。

  1. 呼び出し時に作られる環境
  2. 呼び出し時に作られる環境の親となる環境
  3. 関数がある環境

関数呼び出しの時に何が起こるか。

例えば、コンソール上(環境は.GlobalEnv

> environment()
<environment: R_GlobalEnv>
> search()
 [1] ".GlobalEnv"        "tools:RGUI"        "package:stats"     "package:graphics"  "package:grDevices" "package:utils"     "package:datasets"  "package:devtools"  "MacJapanEnv"      
[10] "package:methods"   "Autoloads"         "package:base"     

で

> mean(1:3)

を実行したときの話を考えます。

  1. .GlobalEnvでmeanを探して、なければその親をたどっていく。
  2. package:basemeanを見つける。
  3. 適当な環境Xを作って、その親としてmeanの環境をヒモづける。
  4. 環境X上でmeanの中の式を実行する。

関数がある環境と関数の環境

サラッとmeanの環境と書きましたが、これは上の関数にまつわる3つの環境の中の3のことで、関数の環境です。
関数の環境はenvironment()で、

> environment(mean)
<environment: namespace:base>

関数がある場所はfind()で、

> find("mean")
[1] "package:base"

というように調べられます。はい、この二つ、関数がある環境(package:base)と関数の環境(namespace:base)は異なります。

普通の関数のある場所と関数の環境

ちょっとそれますが、.GlobalEnvで関数を定義したときは、関数の環境も関数がある環境も両方共.GlobalEnvです。
普通は、関数の環境は関数が作られた環境になるので、関数の環境と関数のある環境は一致しますが、これが常に成り立つわけではない、というのは前に説明したとおりです。

パッケージ内の関数を呼び出したときの変数検索

meanの環境はnamespace:baseです。ですので、meanを呼び出したときにどういう風に変数を探すかというと、

> debug(mean) # デバッグする
> mean(1:3) # 呼び出す
debugging in: mean(1:3) # デバッガに入る
debug: UseMethod("mean")
Browse[2]> environment() # 今の環境。これは関数呼び出しで適当に作った物
<environment: 0x11903b668>
Browse[2]> parent.env(environment()) # その親。namespace:baseですね。
<environment: namespace:base>
Browse[2]> parent.env(parent.env(environment())) # その親。
<environment: R_GlobalEnv>
Browse[2]> parent.env(parent.env(parent.env(environment()))) # その親。
<environment: 0x101e955c0>
attr(,"name")
[1] "tools:RGUI"
Browse[2]> parent.env(parent.env(parent.env(parent.env(environment())))) # その親
<environment: package:stats>
attr(,"name")
[1] "package:stats"
attr(,"path")
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/stats"

という感じです。

正しく書くと、

  1. 関数呼び出しで作られた環境
  2. 関数の環境(パッケージの名前空間)
  3. .GlobalEnv
  4. 以降、seaerch()と同じ道をたどる。

となります。実際には、baseパッケージ以外の時は2のあとにbaseパッケージ名前空間が入ります。

面倒なので最後まで環境をたどる関数を定義します。

> f <- function(e = parent.frame()) while (!identical(e, emptyenv())) {print(environmentName(e)); e <- parent.env(e)}
> f()
[1] "R_GlobalEnv"
[1] "tools:RGUI"
[1] "package:stats"
[1] "package:graphics"
[1] "package:grDevices"
[1] "package:utils"
[1] "package:datasets"
[1] "package:devtools"
[1] "MacJapanEnv"
[1] "package:methods"
[1] "Autoloads"
[1] "base"

meanの呼び出しでは

> debug(mean)
> mean(1)
debugging in: mean(1)
debug: UseMethod("mean")
Browse[2]> f()
[1] "" # これ適当に作られるやつ
[1] "base" # base名前空間
[1] "R_GlobalEnv"
[1] "tools:RGUI"
[1] "package:stats"
[1] "package:graphics"
[1] "package:grDevices"
[1] "package:utils"
[1] "package:datasets"
[1] "package:devtools"
[1] "MacJapanEnv"
[1] "package:methods"
[1] "Autoloads"
[1] "base" # package:base

statsパッケージのrnormの場合はこうなります

rowse[2]> debug(rnorm)
Browse[2]> rnorm(1)
debugging in: rnorm(1)
debug: .Internal(rnorm(n, mean, sd))
Browse[4]> f()
[1] "" # 適当に作られたやつ
[1] "stats" # stats名前空間
[1] "imports:stats" # stats名前空間へのインポート
[1] "base" # base名前空間
[1] "R_GlobalEnv"
[1] "tools:RGUI"
[1] "package:stats"
[1] "package:graphics"
[1] "package:grDevices"
[1] "package:utils"
[1] "package:datasets"
[1] "package:devtools"
[1] "MacJapanEnv"
[1] "package:methods"
[1] "Autoloads"
[1] "base" # package:base

という感じです。

インポート???

それはまた別の機会に説明します。

つづく・・・

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