homebrew を利用し各種コマンド等をインストール

こんにちは。
各種コマンド等をhomebrew を利用しインストールして使っておりますが、方針を整理してみました。

$ brew tap caskroom/cask brewsci/science brewsci/bio

1. brew install を用いてインストールしたコマンド等

• gcc
• ghostscript
• opencv3
• python3
• numpy
• scipy
• pybind11
• ipython
• percol
• meson
• gdal
• postgis
• fonttools
• tensorflow¹
• protobuf
• spatialindex

2. brew cask install を用いてインストールしたモジュール

• xquartz
• java
• cuda
• docker

3. brew cask fetch を用いて取ってきたモジュール

• mactex (手動でインストールし²、その際にghostscriptは除く³。brew installでインストール済みで、mactex由来のものは不要なので。)

4. pip3 install を用いてインストールしたモジュール（package）

• pillow
• matplotlib
• pandas
• seaborn

python package の確認

なお上記の 1 （brew install を用いてインストール）を行うと、必ずしも最新ではない python モジュールがインストールされます。試しに確認すると下記のようになりました。

$ pip3 list --outdated
Package Version Latest Type 
------- ------- ------ -----
GDAL    2.4.2   3.0.2  sdist
numpy   1.17.4  1.18.1 wheel
scipy   1.3.3   1.4.1  wheel

モジュールの依存関係確認

なお、homebrew モジュールの相互依存関係は下記のようにすれば確認できます。

$ brew uses ghostscript --installed
djvu2pdf
$ brew uses numpy --installed
osgeo/osgeo4mac/gdal2-python

オプションで付けたモジュールを確認するには、

$ ffmpeg --with-tools --with-x265
$ brew uses x265 --installed --include-optional
ffmpeg
$ brew uses x265 --installed
$

1. Intel Mac の場合 ↩

2. 削除したい場合は、rm -rf /usr/local/texlive /Library/TeX /Applications/TeX ↩

3. 参照：「MacTeX がインストールする ghostscript 関係ファイル一覧を確認」 ↩