こんにちは。
Javascript で object の中身を出力表示させ、JSON.stringify の出力と比較してみました。Node.js 利用でコマンドラインで動かしました¹。

$ ./print.js 
{"0":["1","2"],"3":["4"]}  // JSON.stringify（比較用）
{0:[1,2],3:[4]}  // print_object()

print.js

# !/usr/bin/env node

function tostring(x, braces) {
  var arr = [];
  if (x instanceof Array) {
    if (braces === undefined) braces = "[]";
    arr.push(braces[0]);
    for (var i=0; i < x.length; i++) {
      if (i>0) arr.push(",");
      arr.push(tostring(x[i]));
    }
    arr.push(braces[1]);
    return arr.join("");
  }
  else if (x instanceof Object) {
    for(var k in x){
      arr.push(k + ":" + tostring(x[k]));
    }
    return tostring(arr, "{}")
  }
  else return x.toString();
}

function print_object(x) {print(tostring(x));}

function print(str) {process.stdout.write(str + '\n')};

var obj = {"0": ["1", "2"], "3": ["4"]};
print(JSON.stringify(obj));
print_object(obj);

「node.jsによるコマンドラインツール導入」 ↩