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@kimisyo(晶公畑)

mordredで記述子が3次元座標を必要とするかどうかを取得

Posted at 2019-02-10

背景

フリーの記述子計算ソフトmordredにおいて、3次元座標がないと計算ができない記述子もあり、3次元座標あり/なしでその記述子を計算するかどうかを切り分けたい。

環境

Windows10
Anaconda
python3.X
mordred 1.1.1

やり方

以下の通り、記述子オブジェクトのrequire_3Dメソッドで取得可能

from rdkit import Chem
from mordred import Calculator, descriptors

calc = Calculator(descriptors, ignore_3D=False)

for i, desc in enumerate(calc.descriptors):
　　print(desc.require_3D)

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