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numpyの配列やpandasのデータフレームをファイルとして保存したい

Last updated at Posted at 2019-05-28

まず、適当に配列やデータフレームを作ります。

sample.py
import pandas as pd
import numpy as np
txt =np.array([letter for letter in 'abcdefghijklmno']).reshape(3,5)
array = np.arange(12).reshape(3,4)
df = pd.DataFrame(array.T, index=['A','B','C','D'],columns=['a','b','c'])
print(txt) >>>
[['a' 'b' 'c' 'd' 'e']
 ['f' 'g' 'h' 'i' 'j']
 ['k' 'l' 'm' 'n' 'o']]

print(array) >>>
[[ 0  1  2  3]
 [ 4  5  6  7]
 [ 8  9 10 11]]

print(df) >>>
   a  b   c
A  0  4   8
B  1  5   9
C  2  6  10
D  3  7  11

まず、numpyのコマンドで配列やデータフレーム、リストを保存して、さらにロードします。

sample.py
np.savetxt('save1.txt', array)
np.save('save2.npy', txt)
np.savez('save3.npz', save_array=array, save_df=df)
np.save('save4.npy', [1,2,3])

loaded_array=np.loadtxt('save1.txt')
loaded_txt=np.load('save2.npy')
loaded_array_df=np.load('save3.npz')
loaded_list=np.load('save4.npy')

print(loaded_array) >>>
[[ 0.  1.  2.  3.]
 [ 4.  5.  6.  7.]
 [ 8.  9. 10. 11.]]

print(loaded_txt) >>>
[['a' 'b' 'c' 'd' 'e']
 ['f' 'g' 'h' 'i' 'j']
 ['k' 'l' 'm' 'n' 'o']]

print(loaded_array_df['save_array']) >>>
[[ 0  1  2  3]
 [ 4  5  6  7]
 [ 8  9 10 11]]

print(loaded_array_df['save_df']) >>>
[[ 0  4  8]
 [ 1  5  9]
 [ 2  6 10]
 [ 3  7 11]]
#元はデータフレームだったのに配列になっている。

print(loaded_list) >>>
[1 2 3]

基本的にnp.save()で保存し、np.load()でロードできます。np.savez()で一つのファイルに複数の配列を保存することができます。複数保存するときは名前を付けるとロードするときに便利です。ここでデータフレームは、インデックスや列名は保存されず、ロードしてみると要素だけの配列になってしまうので注意です。
データフレームをきちんと保存して取り出すには.to_csv()で保存し、pd.read_csv()で読みださねばなりません。しかしインデックスの列が要素に含まれてしまうときは、オプションとしてindex_col=0としましょう。これは0列目をインデックスにすることを意味します。

sample.py
df.to_csv('save5.csv')
loaded_df = pd.read_csv('save5.csv')
loaded_df2 = pd.read_csv('save5.csv', index_col=0)

print(loaded_df) >>>
  Unnamed: 0  a  b   c
0          A  0  4   8
1          B  1  5   9
2          C  2  6  10
3          D  3  7  11

print(loaded_df2) >>>
   a  b   c
A  0  4   8
B  1  5   9
C  2  6  10
D  3  7  11

#追記
投稿後に頂いたコメント(@nkay さんより)の中で指摘がありましたので追記します。
以下のように、.to_pickle()で保存し、pd.read_pickle()でロードすると、オプションなしで元の形でデータフレームを保持できます。こちらのほうが便利ですね。ご教授いただきありがとうございました。

sample.py

>>> df.to_pickle("save.pkl")
>>> 
>>> loaded_df = pd.read_pickle("save.pkl")
>>> print(loaded_df)
   a  b   c
A  0  4   8
B  1  5   9
C  2  6  10
D  3  7  11
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