多分Ubuntuじゃなくてもxsel入れば何でもいいと思う。
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apt-get install xselとかでxsel(クリップボード操作するツール)インスコする -
.tmux.confに以下のように書く
setw -g mode-keys vi
bind-key -t vi-copy Enter copy-pipe "cat | xsel -i --clipboard"
コピーモードのキーバインドをvim風にする設定と混じってる気がするけどよく分からないのでtmuxマスターの皆さんは適宜読み替えてください。
ペーストは知りません、適当にやってください。
僕はクリップボードへ入りさえすれば満足だった。