クロスアカウント環境下にて、GuardDutyをONにしておき
集約するアカウントをGuardDutyのアカウント機能でMasterとして
それ以外のアカウントのGuardDutyをMemberと設定している場合。

上記のような環境は良くある構成だと思いますし、以下公式にもある通り
MasterのアカウントにおいてCloudWatchEvents(以下「CWE」）と
Lambdaで通知を実装しているかと存じます。
https://docs.aws.amazon.com/guardduty/latest/ug/guardduty_findings_cloudwatch.html

その場合、CWEでハンドルできるのは集約アカウント上のGuardDutyが
検知したイベントのみです。Memberとしたアカウント上のGuardDutyイベントは
マネジメントコンソール上は参照可能ですが、CWEでハンドルできません。

GuardDutyでMaster-Memberの制御を入れればMaster側にイベントが集約できるかと
思っていましたが、各アカウントごとにCWEを設定する必要があります。

集約アカウントにおけるCWEのRule

{
  "source": [
    "aws.guardduty"
  ],
  "detail-type": [
    "GuardDuty Finding"
  ]
}

Memberアカウント側でサンプルイベント作成

Masterアカウント側のCWEは上記サンプルイベントを検知できず・・・

先日、GuardDutyにS3へ書き込みする機能がリリースされました。クロスアカウント環境において
GuardDutyの通知も集約したい場合は集約アカウント上にバケットを作成し
各アカウントからそのバケットに対してイベントをPUTして、バケットのPUTイベントを
Lambdaでハンドルして読み込み／解析するのが一番単純な形かと存じます。

2020/03/06 追記しました

試したところメンバー側のイベントをマスター側のCWEで取得できるようになりました。

メンバー側でイベントを起こす

マスター側のCWEで取得できる

クロスアカウント環境下においてCWEでGuardDutyのイベントを取得しようとした場合
マスターアカウント分しか取得できない、使うべきでないと書きましたが
現時点ではメンバーアカウントのイベントも取得できるようになったようです。