0
0

多原子イオンを点置換した新しい結晶構造作成ログ(四面体形編)

Last updated at Posted at 2024-01-29
time ./do_mk_polyatomic_ion_replaced_point_poscar.sh

target_ion_name: AlCl4
central_atom_symbol: Al
neighboring_atom_symbol: Cl
bond_length_lower_end: 1.80
bond_length_upper_end: 2.70
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/AlCl4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|██████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 170/170 [00:05<00:00, 31.01it/s]

real 0m6.289s
user 0m24.526s
sys 0m2.638s

  • 1004036
    image.png
    image.png
    image.png

  • 1004038
    image.png
    image.png
    image.png

  • 1004043
    image.png
    image.png
    image.png
    image.png

target_ion_name: BF4
central_atom_symbol: B
neighboring_atom_symbol: F
bond_length_lower_end: 1.19
bond_length_upper_end: 1.79
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/BF4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 2748/2748 [02:11<00:00, 20.92it/s]

real 2m12.074s
user 10m35.075s
sys 0m38.375s

  • 1010094
    image.png
    image.png
    image.png

image.png
image.png
image.png

target_ion_name: BH4
central_atom_symbol: B
neighboring_atom_symbol: H
bond_length_lower_end: 0.94
bond_length_upper_end: 1.40
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/BH4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|██████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 209/209 [00:10<00:00, 19.28it/s]

real 0m11.415s
user 0m53.754s
sys 0m3.678s

  • 1504402
    image.png
    image.png
    image.png

target_ion_name: ClO4
central_atom_symbol: Cl
neighboring_atom_symbol: O
bond_length_lower_end: 1.22
bond_length_upper_end: 1.94
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/ClO4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 4189/4189 [03:28<00:00, 20.09it/s]

real 3m29.309s
user 17m8.465s
sys 0m57.531s

  • 1010214
    image.png
    image.png

image.png
image.png

target_ion_name: MnO4
central_atom_symbol: Mn
neighboring_atom_symbol: O
bond_length_lower_end: 1.30
bond_length_upper_end: 2.18
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/MnO4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|██████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 120/120 [00:05<00:00, 23.86it/s]

real 0m5.676s
user 0m23.929s
sys 0m2.032s

target_ion_name: SO4
central_atom_symbol: S
neighboring_atom_symbol: O
bond_length_lower_end: 1.21
bond_length_upper_end: 1.99
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/SO4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 1855/1855 [01:08<00:00, 26.92it/s]

real 1m9.530s
user 5m26.890s
sys 0m21.104s

  • 1000027
    image.png
    image.png

target_ion_name: SeO4
central_atom_symbol: Se
neighboring_atom_symbol: O
bond_length_lower_end: 1.31
bond_length_upper_end: 2.15
target_npy_p: ../get_some_ion_contained_pos_folder_p_list/SeO4_contained_poscar_folder_path_list_ver2.npy
os.path.exists(target_npy_p): True
100%|██████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████| 159/159 [00:05<00:00, 30.72it/s]

real 0m5.683s
user 0m23.656s
sys 0m2.479s

real 7m20.006s
user 35m16.295s
sys 2m7.847s

  • 1509876
    image.png
    image.png
    image.png
0
0
0

Register as a new user and use Qiita more conveniently

  1. You get articles that match your needs
  2. You can efficiently read back useful information
  3. You can use dark theme
What you can do with signing up
0
0