例えば hoge という名前のファイルがどの場所にあるのか完全に忘れてしまった（あるいは知らない）のであれば・・・
sudo find / -name hoge
こうすると管理者権限でルートディレクトリ以下（要するにマシン上の全データ）の中から -name 後に挙げた名前を検索してくれる。
時間はかかるが、 実在するファイルなら確実に居場所が判明する ので最終手段として使える（ある程度場所に見当がついているのであればそこから下で検索をかけたほうが早いが）。
参考
UNIX：http://www.k-tanaka.net/unix/find.php
Linux：http://itpro.nikkeibp.co.jp/article/COLUMN/20060227/230777/
どっちも同じか？