問題
gitから新しくRailsアプリをチェックアウトしてきたり、Rubyのバージョンを上げたりして、 bundle install を実行すると以下のようなエラーが出る。
（did_you_mean-0.8.0 の部分は状況によって変わる）
bundle install
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/
Could not find did_you_mean-0.8.0 in any of the sources
原因
Gemfile.lock で指定されているgemのバージョンがyank（削除）されてしまっている。
確認方法
http://rubygems.org/ にアクセスして、問題が出ているgemを検索する。
エラーになっているgemのバージョンがリストになければyankされている。
例: http://rubygems.org/gems/did_you_mean
バージョン0.8.0がない。
解決策
対象のgemをupdateする。
bundle update did_you_mean
備考1
バージョンが大きく変わってしまう場合は後方互換性がなくなっているかもしれないので、Gemfileで適切なバージョンを指定してから bundle update する。
gem 'did_you_mean', '~> 0.9.0'
備考2
他にもyankされているgemがある場合は同時にupdateする。
エラーの例
bundle update did_you_mean
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/
Could not find jpmobile-4.1.2 in any of the sources
同時にupdate
bundle update did_you_mean jpmobile