目的
Python3を使って測定装置がはき出すX（波長、電圧、時間など）ｰY（吸光度、電流など）がリストになったcsv(txt)ファイルからデータを読み出す。
話の前提
- Python3/pandasが使える
- pd.DataFrameが各行各列に名前をつけられるマトリクス形式のデータ構造であることを知っている。
- Jupyter notebookを使っている（必須ではない）
- 測定ファイルはdata.csv
日時：2019/1/1
開始波長（nm）：300
終了波長（nm）：800
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波長, 吸光度
300, 0.00000
310, 0.00010
320, 0.00100
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多くの測定データファイルは上記のようにヘッダー部分（日時や装置名などのメタデータが書かれた部分）と測定結果をリストにしているメイン部分に分かれている。今は、メインのデータをPython3で取り込み、その後の加工に使いたい。
方法
入力
import pandas as pd
f = 'data.csv'
df = pd.read_csv(f, sep=',', skiprows=6, skip_footer=1, header=None)
df.columns = ['WL', 'ABS']
print(df)
出力
WL ABS
0 300 0.0000
1 310 0.0001
2 320 0.0010
解説
pandasのもつread_csvという関数を使う。この関数には多くのの引数があり、柔軟にCSVファイルを読み込むことができる（https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.read_csv.html）。
今回明示的に指定した引数は以下の通り。
-
ファイル名
f：読み出すファイルの名前。一番最初の引数とする。 -
sep：separatorの略で、データ間を切り分けるための目印となる文字種を指定できる。CSVはその名の通り、Comma Separated Valuesの略なので、今回のケースではカンマを指定する。実は、この引数はそもそもsep=','、とカンマが指定されており、このケースでは明示的にこの値を指定する必要はない。ただし、多くの測定器の出力ファイルがtsv (tab separated values）の形式であるので、その場合はsep='¥t'と指定する。 -
skiprows：頭から何行目までを飛ばして読み込みを開始するかを指定する。今回は波長, 吸光度まで不要だったので6とした。 -
skip_footer：ファイル末尾に不要な行があるときに指定する。今回は最後の>>>>>>>の１行分が不要なので１とした。 -
header：各列名を指定する行番号をskiprowsで飛ばした後の0行目から指定する。今回はファイル中に波長, 吸光度という行があるが、後ほど自分で指定したかったので、header=Noneと指定して、どの行も列名として読み込まないようにした。
最後にdf.columns = ['WL', 'ABS']でDataFrameの列名をアップデートする。