networkxメモ

TL;DR

networkxを使って解析することが多かったので簡単にメモ
そのうち記事にするかも

spring layoutの固定

spring layoutで書くと毎回違うネットワークが生成させるので、固定したい。
numpyのrandomseedを固定すれば生成されるネットワークを固定できる。

import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

np.random.seed(10)

G = nx.read_gml("/path/to/gmlfile")
pos = nx.spring_layout(G)
fig, ax = plt.subplots()

nx.draw_networkx_nodes(G, pos, ax=ax)
nx.draw_networkx_edges(G, pos, ax=ax)
plt.show()