リストにNULLが含まれるとtibbleにできないので、NAに強制変換する

TL;DR

NULLが含まれるリストはas_tibble()が使えないので、先にNULLをNAに置換するといいよ

リストをtibbleにしたいが、エラーが出る

スクレイピングなどで取得したリスト形式のデータは、tidyverse的にas_tibble()を使ってdata.frameに変換すると、扱いやすいです。
ですが、リストの要素にNULLが含まれていると、エラーがでます。

list_to_tibble.r

library(magrittr)
library(tibble)

data <- list(lm_id = "LMFA0000001", name = "2-methoxy-12-methyloctadec-17-en-5-ynoyl anhydride", main_class = "Other Fatty Acyls [FA00]", sub_class = NULL)
data

$lm_id
[1] "LMFA0000001"

$name
[1] "2-methoxy-12-methyloctadec-17-en-5-ynoyl anhydride"

$main_class
[1] "Other Fatty Acyls [FA00]"

$sub_class
NULL # <- NULLなのでエラーになる

list_to_tibble.r

data %>% as_tibble
Error: All columns in a tibble must be 1d or 2d objects:
* Column `sub_class` is NULL
Call `rlang::last_error()` to see a backtrace

リストに含まれるNULLをNAに置換する

NULL値があるといけないので、lapply()を使って、NULLをNAに置換してます。

list_to_tibble.r

data %<>% lapply(function(x) if(is.null(x)) {NA} else {x})
data
$lm_id
[1] "LMFA0000001"

$name
[1] "2-methoxy-12-methyloctadec-17-en-5-ynoyl anhydride"

$main_class
[1] "Other Fatty Acyls [FA00]"

$sub_class
[1] NA # NULLからNAに置換

NAにすれば、as_tibble()でdata.frameに変換できます。

list_to_tibble.r

data %<>% as_tibble
data
# A tibble: 1 x 4
  lm_id      name                                  main_class          sub_class
  <chr>      <chr>                                 <chr>               <lgl>
1 LMFA00000~ 2-methoxy-12-methyloctadec-17-en-5-y~ Other Fatty Acyls ~ NA