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Pandas DataFrame を .csv.gz として Amazon S3 に保存する

Pandas DataFrame を gzip 圧縮しつつ CSV ファイルとして Amazon S3 バケットに保存しようとしたときに少しハマったので備忘録。

import gzip
from io import BytesIO
import pandas as pd
import boto3

def save_to_s3(df: pd.DataFrame, bucket: str, key: str):
    """Pandas DataFrame を .csv.gz として Amazon S3 に保存する"""
    buf = BytesIO()
    with gzip.open(buf, mode="wt") as f:
        df.to_csv(f)
    s3 = boto3.client("s3")
    s3.put_object(Bucket=bucket, Key=key, Body=buf.getvalue())

ポイントとしては以下。

  • gzip.open の第一引数は gzip フォーマットを表す file-like オブジェクトなので BytesIO() を入力する
  • pandas.DataFrame.to_csv の出力は文字列なので、gzip.openmode は「テキスト書き込み (wt)」を指定する

最初 pandas.DataFrame.to_csvcompression="gzip" を指定すれば明示的に圧縮しなくてもいけるかと思って試したが、 to_csv に file-like オブジェクトを入力した場合は compression オプションは無視されるらしく、使えなかった。

hoto17296
ゆとりデータ分析マン
https://hoto.me/
churadata
沖縄で データ分析 / 機械学習 / Deep Learning をやっている会社です
https://churadata.okinawa/
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