Macbook US 配列と HHKB US 配列を快適に使うキーボードマッピングの設定方法をまとめます。

macOS はコントロール + スペースでかな <-> 英字と切り替えが可能です。
自分は、左コントロール（単独） -> 英字、右シフト（単独） -> かなに切り替えで運用しています。

macOS システム設定のキーボード修飾キーの設定
Karabiner-Elements アプリでかな入力と英字入力の切り替えを設定

Karabiner-Elements アプリをインストールします
https://karabiner-elements.pqrs.org

インストールが終わったら、アナウンスに従ってバックグラウンドでの実行の許可、入力監視の許可をします。

~/.config/karabiner/karabiner.json にコピペします。

{
    "global": { "show_in_menu_bar": false },
    "profiles": [
        {
            "complex_modifications": {
                "rules": [
                    {
                        "description": "Right Shift alone -> Kana",
                        "manipulators": [
                            {
                                "from": {
                                    "key_code": "right_shift",
                                    "modifiers": { "optional": ["any"] }
                                },
                                "to": [{ "key_code": "right_shift" }],
                                "to_if_alone": [{ "key_code": "japanese_kana" }],
                                "type": "basic"
                            }
                        ]
                    },
                    {
                        "description": "Left Control alone -> Eisu",
                        "manipulators": [
                            {
                                "from": {
                                    "key_code": "left_control",
                                    "modifiers": { "optional": ["any"] }
                                },
                                "to": [{ "key_code": "left_control" }],
                                "to_if_alone": [{ "key_code": "japanese_eisuu" }],
                                "type": "basic"
                            }
                        ]
                    }
                ]
            },
            "name": "Default profile",
            "selected": true,
            "simple_modifications": [
                {
                    "from": { "key_code": "caps_lock" },
                    "to": [{ "key_code": "left_control" }]
                }
            ],
            "virtual_hid_keyboard": { "keyboard_type_v2": "ansi" }
        }
    ]
}

macOS システム設定のキーボード修飾キーの設定

Apple内蔵キーボード
Karabiner DriverKit
HHKB

それぞれのキーボードを設定すれば OKです。