PhpStorm で ctrl+shift+F を使いパス内のファイルを検索した場合
100件以上のファイルが表示できませんでした。
同様の内容は既に投稿されていました
https://qiita.com/naoki_koreeda/items/74894904caf29bb639d4
こちらの方を参考にしましたが日本語化している影響なのか
レジストリ編集画面を表示させることができなかったので自分が見つけた解決策を記しておきます

ヘルプ
カスタムVMオプションの編集...
カスタムVMオプションに以下を追加
-Dide.usages.page.size=10000

これで100件以上の検索結果が表示されるようになりました
自分はとりあえず10000としていますが大きすぎるとメモリ使用量は増えるので適宜調整してください