Mac(El Capitan)でpythonを使ってデータ分析をするための環境を構築します。

事前準備

homebrew

http://brew.sh/index_ja.html
macのパッケージ管理ツールであるhomebrewをインストールします。

$ /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"

homebrew cask

後述のminicondaがhomebrewには存在していないため、homebrew caskをインストールします。

$ brew tap caskroom/cask

miniconda

仮想環境を管理するためのツールとしてminicondaをインストールします。

$ brew cask install miniconda

インストールしたminicondaにPATHを通すため、.bash_profile等に以下の記述を追加します。<user_name>を任意のユーザに置き換えてください。

~/.bash_profile

export PATH="/Users/<user_name>/miniconda3/bin:$PATH"

pythonの環境管理ツールは色々あるようですが、今のところcondaだけでも不便はしていません。
不便な点をご存知の方は教えてください。

仮想環境の構築

minicondaで分析するための仮想環境を作ります。
環境作成時に必要なパッケージを指定するとインストールされます。pandas, numpy, matplotlib, scikit-learn, jupyter等でしょうか。基本的にはanacondaで全部入ります。

$ conda create -n testenv python=3 anaconda

仮想環境に切り替えます。プロンプトの先頭に(環境名)が表示されます。

$ source activate testenv
(testenv) $

仮想環境から元の環境に戻る時は以下の通り。

(testenv) $ source deactivate
$

追加パッケージのインストール

conda

仮想環境にパッケージを追加したい時はcondaで探してインストールできます。

(testenv) $ conda search graphviz
Fetching package metadata .......
graphviz                     2.38.0                        2  defaults        
                             2.38.0                        3  defaults        
                             2.38.0                        4  defaults        
(testenv) $ conda install graphviz

探して見つからなくてもGoogleで検索して見つかればchannelを指定してインストールすることもできます。
jupyter notebook起動時に"No module named 'nbbrowserpdf'"という警告が出るので、インストールしてみます。

(testenv) $ conda install --channel anaconda-nb-extensions nbbrowserpdf

pip

それでも見つからない、またはcondaで希望のバージョンが提供されていない、などであれば、pipを使ってその仮想環境にパッケージをインストールすることもできます。

(testenv) $ pip install tansorflow

その他

Jupyter notebookのTips

数式の横に表示される縦棒を消す

~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py

c.NotebookApp.mathjax_url = 'https://cdn.mathjax.org/mathjax/latest/MathJax.js'

コードと出力のフォントを変更

~/.jupyter/custom/custom.css

.CodeMirror pre, .output pre { font-family: "Source Han Code JP", monospace; }

拡張機能のメニューを追加

$ conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions

Mac(El Capitan)にpythonのデータ分析環境を構築