Docker上でCojureのデータ解析ツールGorilla REPLを動かす #Docker

前書き

Gorilla REPLはClojure製のノートブックスタイルのデータ解析ツールです。
Clojure版のiPython Notebookと言った方がイメージしやすいでしょうか。

Docker imageを作りましたので、今回はCoreOS上で動かすやり方を説明します。

以下のインストールが事前に必要です。

CoreOSの公式Vagrantfileを使用します。
デフォルトだと1台だけ起動します。

git clone https://github.com/coreos/coreos-vagrant/
cd coreos-vagrant
vagrant up

あとはログインして以下のコンテナを起動するだけです。
naohisa/incanter-gorilla

docker run --name some-gorilla -p 4242:4242 -p 80:8080 -d naohisa/incanter-gorilla

特に設定を変更していなければ以下のURLをブラウザで開けばアクセスできます。
http://172.17.8.101/worksheet.html

leiningenのreplだと以下のコマンドで開けます。（nREPL等でもエンドポイントは一緒）

lein repl :connect 172.17.8.101:4242

以下のように表示されれば成功です。

まずはnamespaceとライブラリの読み込みをするため、以下を入力してshift + enterします。

(ns divine-meadow
  (:require [clojure.java.jdbc :as jdbc])
  (:use [incanter core stats charts io datasets]
        [incanter-gorilla render]))

データベースへの接続情報を以下のような感じで定義しておきます。

(def db-info
  { :subprotocol "mysql"
    :subname "//[database host]:3306/database"
    :user "user_name"
    :password "password"})

jdbc経由でデータをとって来るには以下のようにします。

(def hoge-data
  (jdbc/query db-info
    ["select * from hoge where id > ? " "10"]))))

この場合、hoge-dataは遅延シーケンスでデータ的にはmapです。
これをIncanterで処理できるようにdatasetに変換します。

(def hoge-dataset
  (to-dataset hoge-data))

あとは以下のような感じで平均値を求めたり、グラフの描画もできます。

(mean ($ :price ($where {:year {= 2015}} hoge-dataset)))
(chart-view
  (scatter-plot :price :amount :group-by :month :data hoge-dataset))