結論

VSCodeで編集したipynbファイルをJupyterLabで編集しようとしたのが問題．
VSCodeでテキストエディタ―を用いてファイルを開いたら「\r\n」を全て「\n」に置換しましょう．
今後VSCodeでの行末文字を\nにすれば同じ問題は起きないと思います．多分．

なんで起きたか

今まではipynbの編集をVSCodeで行っていたものの，突如VSCodeが鬼のように重くなり使い物にならなくなったためとりあえずJupyterLabに避難．その後編集中にタイトルのような「code editor out of sync」というエラーが表示され始めた．

本当はVSCodeが重たいのをどうにかしたいけどどうにも治らないのでしばらくJupyterLabで我慢します．