Please use LAMMPSRUN.set() への対処法

はじめに

Atomic Simulation Environment (ASE)のバージョンを更新したら，
'''
srun.py:190: UserWarning: You are using an old syntax to set 'parameters'.
Please use LAMMPSRUN.set().
warnings.warn(self.legacy_warn_string.format("parameters"))
'''
という警告が出たので，調査しました．

原因

ASEのlammpsrunのソースコードを読むと，legacy_parametersという変数が見つかる．
legacy...と思いながら対応する箇所を探すと，

        if "parameters" in kwargs:
            old_parameters = kwargs["parameters"]
            if isinstance(old_parameters, dict):
                warnings.warn(self.legacy_warn_string.format("parameters"))
                del kwargs["parameters"]
        else:
            old_parameters = None
        
        Calculator.__init__(self, label=label, **kwargs)
        
        if old_parameters and isinstance(old_parameters, dict):
            self.set(**old_parameters)

というコードが見つかる．
つまり，LAMMPSを呼び出す際に

LAMMPS(parameters=params)

等としていたのが問題で，

calculators = LAMMPS(parameters=params)
calculators.set(**params)

等としてあげれば，警告が表示されなくなります．