環境：GCE(Google Compute Engine)

Google Compute Engine

マシンタイプ：g1-small（vCPU x 1、メモリ 1.7 GB）
OS:Ubuntu
VERSION:16.04.2

Google Cloud Platform SQL

PostgreSQL 9.6

Google Cloud Storage

マストドンのUpgrade notesを確認:

release notes:https://github.com/tootsuite/mastodon/releases/tag/v1.4.1

Non-Docker only:

This release switches the minimum supported Node.js version from 4 to 6
Three additional system packages are required: pkg-config libprotobuf-dev protobuf-compiler
Dependency updates: bundle install and yarn install

必要なNode.jsバージョンが4から6に変更になっています
３つのシステムパッケージが追加で必要になりました

pkg-config
libprotobuf-dev
protobuf-compiler

bundle install と yarn installを行い依存関係を更新

Docker-only:

-略-

Both Docker and non-Docker:

If you have CDN_HOST set, make sure it contains the protocol part (http:// or https://), if it does not, adjust it before doing the next step
If you set a non-default STREAMING_API_BASE_URL, change the protocol part to ws:// or wss:// respectively
This release includes changes to assets, that means you need to run RAILS_ENV=production bundle exec rails assets:precompile (in Docker: docker-compose run --rm web rails assets:precompile)
Generated assets now live under public/packs instead of public/assets. This is mostly irrelevant but might affect some custom proxying configurations.
This release includes database migrations, that means you need to run RAILS_ENV=production bundle exec rails db:migrate (in Docker: docker-compose run --rm web rails db:migrate)

CDN_HOSTを設定している場合、プロトコル部分(http:// または https://)を含んだ形で設定しているかを確認
STREAMING_API_BASE_URLをデフォルト以外で設定している場合、プロトコル部分を[ws://] または [wss://]に変更
RAILS_ENV=production bundle exec rails assets:precompile
を実行
RAILS_ENV=production bundle exec rails db:migrate
を実行

手順

node.jsのバージョンを確認　

$ node -v
v4.8.3

npmでnをインストール

$ sudo npm cache clean
$ sudo npm install -g n

nでnodeを最新のstableに変更

$ n stable
$ node -v
v8.0.0

nodeのバージョンが8.0.0に上がったことを確認

３つのシステムパッケージを追加

$ sudo apt-get install pkg-config
$ sudo apt-get install libprotobuf-dev
$ sudo apt-get install protobuf-compiler

CDN_HOSTとSTREAMING_API_BASE_URLを確認

$ su - mastodon
$ cd live
$ cat .env.production

.env.production

 ~
# CDN_HOST=assets.example.com
 ~
# Streaming API integration
# STREAMING_API_BASE_URL=

特に設定はしていないので変更なし

mastodon Ver.1.4.1を取得

現在のバージョンを確認

$ git branch
* (HEAD detached at v1.3.3)
  master

v1.3.3であることを確認

v1.4.1を取得し、変更

$ git fetch
$ git checkout v1.4.1
Previous HEAD position was a0f7453... Bump version to 1.3.3
HEAD is now at 8963f8c... Bump version to 1.4.1

依存関係の更新

$ bundle install
$ yarn install

DBマイグレーション

$ RAILS_ENV=production bundle exec rails db:migrate

assetsの中をクリアしてmastodon更新

$ RAILS_ENV=production bundle exec rails assets:clobber
$ yarn install --pure-lockfile
$ RAILS_ENV=production bundle exec rails assets:precompile

mastodon再起動

$ sudo systemctl restart mastodon-*.service

備考

$ RAILS_ENV=production bundle exec rails assets:clobber
~略
$ yarn install --pure-lockfile

の実行に１時間以上かかりました。
その間、ディスクreadが高騰(400iops)し、CPU使用率が100%に張り付いていました。
Webからのアクセスにも問題があったようです。
iPhoneのアプリ（Mustor)からはアクセスできていたので、リバースプロキシ(nginx)がうまく動いていなかったのかもしれません・・・？

DBやストレージを外部においていましたが、とくにそのことによる問題はないようでした。