基本的には既存ブログを踏襲しています。
pyenvとminicondaのインストール。conda上の機械学習環境ml_envまでは作成せず。必要ライブラリはcondaで適宜インストール。
参考：http://qiita.com/icoxfog417/items/950b8af9100b64c0d8f9
aws ec2, ubuntu環境におけるcaffe環境整備を以下ブログを踏襲して動作確認（ubuntu14.04,CUDA7.0,cuDNNv3）
参考：https://github.com/BVLC/caffe/wiki/Install-Caffe-on-EC2-from-scratch-(Ubuntu,-CUDA-7,-cuDNN)
-> 最新のCUDA7.5,cuDNN4.0でもうまく行った。
opencvは2.4.9 (or 2.4.10?)をインストールする
参考：http://www.samontab.com/web/2014/06/installing-opencv-2-4-9-in-ubuntu-14-04-lts/
->opencv3.0.0でも試したがうまく行かず。
opencvのビルド中に
nvcc fatal : Unsupported gpu architecture 'compute_11'
と出たら、以下のサイトを参考にopencv/buildのcmake時にGPU architectureを以下のbashで指定して修正
http://stackoverflow.com/questions/28010399/build-opencv-with-cuda-support
cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=Release -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -D BUILD_TIFF=ON -D BUILD_EXAMPLES=ON -D CUDA_GENERATION=Auto -D BUILD_NEW_PYTHON_SUPPORT=ON ..
NCVPixelOperations.hppに関するエラーが出たら、code内のtemplate関数についているstaticをすべて消す
参考：https://devtalk.nvidia.com/default/topic/793805/opencv-2-4-9-won-t-compile/
opencv install中にlibpng16.so.16等のlinkageエラーが出たら、該当する.so等を見つけてきてldconfigにひも付け。
参考：http://stackoverflow.com/questions/32405035/caffe-installation-opencv-libpng16-so-16-linkage-issues
fully convolutionに関するcaffe整備を行う。ただしGPU（CUDA,cuDNN）利用
参考：http://akiomik.hatenablog.jp/entry/2016/01/10/230118
make runtestのコンパイルエラー回避のため
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5_hl.so.10
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5.so.10
を
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5_hl.so.8
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5.so.8
へコピーする必要
参考：https://github.com/BVLC/caffe/issues/1463
libdc1394 error: Failed to initialize libdc1394
というエラーが出たら
sudo ln /dev/null /dev/raw1394
で対処
参考：http://stackoverflow.com/questions/12689304/ctypes-error-libdc1394-error-failed-to-initialize-libdc1394
import caffe時にinvalid syntaxが出たらその行を消すなり、..を.にするなりして修正。
（これで本当に良いのかは不明）
その他参考
ubuntu-desktopをapt-getで入れてしまうと完全にバグるので気をつける。
caffe.ioとnumpyのioが競合するときは下を参考に修正
http://qiita.com/CORDEA/items/9fad27ae024928b6a7b1
aws s3をec2にマウントする
参考：https://www.robusta-hosting.eu/en/blog/development/2015/04/install-s3fs-ubuntu-1404-lts
dropboxのcuiベースな同期をec2上で行う。
参考：http://d.hatena.ne.jp/TrinityT/20141225/1419512389
emacsのpython環境jedi
参考：http://d.hatena.ne.jp/n-channel/20131220/1387551080