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openslideをインストールする手順 [Windows10,Google colab]

Posted at 2021-08-11

#概要#
本記事では、
以下のそれぞれの環境でopenslideをインストールした手順を紹介します。
・Windows10 (Anaconda-Jupyter notebook)
・Google Colaboratory

#実行環境#
[ローカル環境]
Windows 10 Pro(64bit)
Anaconda 4.10.3
JupyterNotebook 6.1.5
Python 3.7.9

#[Windows10]#
##ダウンロード手順##
１．以下のOpenSlide for Windowsのダウンロードページへ行く。
　　https://openslide.org/download/#windows-binaries

２．最新(2017-11-22)の64-bit版をダウンロードする。

##インストール手順##
１．ファイルを展開し、作成されたファイルの中にある
　　binフォルダ内のDLLファイル群全てを
　　現在使用しているpython.exeが置いてあるフォルダに置く。

２．pythonにて"pip install openslide-python"を実行する。

３．インストール成功後に「Note: you may need to restart the kernel to use updated packages.」
　　と表示されるため、カーネルをリスタートする。

##使用開始方法##
・pythonにて"import openslide"を実行。

#[Google Colaboratory環境]#
##インストール手順##
・Google Colaboratory上で以下のコマンドを実行する。

!apt update && apt install -y openslide-tools
!pip install openslide-python

↑インストールが正しく行われたことを確認。

※openslide-toolsをインストールしないとimport時に以下のようなエラーが出ました。

##使用開始方法##
・インストール後、pythonにて"import openslide"を実行。

#参考URL#
以下のQ&Aを参考にしました。