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【MATLAB】空白セル有りCSVファイルを処理する

Last updated at 2021-01-24Posted at 2021-01-24

はじめに

前回はCSVファイルに計算セルを追加してexcelファイルとして保存するやつを実装した．

前回使ったCSVファイルは1行目にデータのラベルがあって各列に同じタイプのデータが並ぶという非常にきれいな作りになっているが，業務で実際取り扱うファイルはもっとぐちゃぐちゃになっている．
ざっくり説明すると以下のような感じ．

同じデータが横方向に並んでいるし，excelで開いた時の'''映え'''を重視して5行目に空行とかG列に空列が入ってたりする．

データが横に並んでいる点についてはmatlabで処理する上では特に問題はなかったが，空白セルが入ってるとそのままでは出力出来なかったので，回避方法を簡単にまとめる．
今回はエラーになってキレそう²になっているところから順に書いていくため，結論だけ見たい場合はスキップしてください．

空白セルをそのまま出力してみる

% ファイルを読み取ってcellに格納
path = 'C:\Users\dejiko';
file = '身長体重_空白セルあり.csv';
filepath = fullfile(path, file);
T = readcell(filepath,'DatetimeType','text');

% データ内容は変更せずにとりあえずそのまま出力する
Tout = T;

% ファイルに書き込む
[path, file] = fileparts(filepath);
newFile = sprintf('%s_matlab.xlsx', file);
outputFilePath = fullfile(path, newFile);
writecell(Tout, outputFilePath);

結果

実行してみると，以下のようなエラーが出て終了してしまった．

エラー: writecell (line 119)
'missing' 型の cell 要素はサポートされていません．書き込む前に，要素を数値，logical，string，datetime，duration または categorical
に変換してください．

とのこと³．

missingの罠

変数Tの中身をmatlabで表示してみると，以下のようになった．空白セルはmissingという型で格納されるらしく，出力する際にこれを何かに変換する必要があるっぽい．

missingを処理

missing部分を空charに置き換える処理を追加する．

実装

% missingを判定
missingCell = cellfun(@ismissing, T, 'UniformOutput',false);
% maskをcell2matしてlogical配列にしたいが，
% char配列のセルについては{1×N(文字数) logical}になっていて，そのままではcell2matできない
% {1×N logical}となっている部分を抽出して{1×1 logical}に置き換える
len = cellfun(@length, missingCell, 'UniformOutput',false);
len = cell2mat(len);
lenMask = len ~= 1;
missingCell(lenMask) = {false};
% 全セルが{1×1 logical}になったのでcell2mat出来る
mask = cell2mat(missingCell);

Tout = T;
% missing部分を空文字に置き換える
Tout(mask) = {''};

解説

まずismissingで各セルがmissingかどうかを判定する．

missingCell = cellfun(@ismissing, T, 'UniformOutput',false);

以下にismissingした結果を示す．
文字列の部分が{1×N logical}となっており，このままではcell2matが出来ない．

次に`{1×N logical}`となる部分を抽出するために，`length`を適用する．

len = cellfun(@length, missingCell, 'UniformOutput',false);
len = cell2mat(len);
lenMask = len ~= 1;

次に`{1×N logical}`の部分を`{false}`に置き換える．

missingCell(lenMask) = {false};

これで全部{1×1 logical}になったので，cell2matしてマスクを作って元のセルにマスクを適用すれば終わりである．

まとめ

空白セルを考慮したexcelファイルの入出力をmatlabで実装した．
引き続きexcelとの和解を果たしていく．

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