タイトル通り、Macで動いていたdocker containerが、Windows環境でrunに失敗しました。
docker-compose.ymlは以下。docker-compose-waitを用いてdb containerの起動待ちを行った後、migration conatianerが起動しtableのmigrationを行う仕組みです。

services:
  db:
    build:
      context: .
      dockerfile: ./images/db/Dockerfile
    volumes:
      - ./db/data:/var/lib/mysql:rw
    restart: always
    ports:
      - "3306:3306"
    env_file:
      - ./envfiles/.db
  migration:
    build:
      context: .
      dockerfile: ./images/migration/Dockerfile
    depends_on:
      - db
    command: ["upgrade head"]
    volumes:
      - ./migration/alembic:/workspace/alembic:rw
    env_file:
      - ./envfiles/.migration

Dockerfileは以下。poetryを使ってalembicをcontainerにインストールします。

FROM python:3.11-bookworm as requirements-stage
WORKDIR /tmp

RUN pip install poetry

COPY ./migration/pyproject.toml ./migration/poetry.lock* /tmp/

RUN poetry export -f requirements.txt --output requirements.txt --without-hashes

FROM python:3.11-bookworm
WORKDIR /workspace

COPY --from=requirements-stage /tmp/requirements.txt /workspace/requirements.txt

RUN pip install --no-cache-dir --upgrade -r /workspace/requirements.txt

ADD https://github.com/ufoscout/docker-compose-wait/releases/download/2.9.0/wait /wait
RUN chmod +x /wait

COPY ./migration/run.sh /usr/local/bin
RUN chmod +x /usr/local/bin/run.sh

COPY ./migration/alembic.ini ./

ENTRYPOINT ["run.sh"]

docker compose buildは通っているのになぜかdocker compose upで以下のようなエラーが出力されました。

migration-1        | exec /usr/local/bin/run.sh: no such file or directory

15分ほど試行錯誤しても解決策が思い浮かばなかったため、github copilot chatに助けを求めると...

どうやら改行コードの修正が必要らしいとのことでした。
半信半疑で指示通りCRLFからLFに変更すると、run.shの中身の見た目は一切変わらずdocker compose upが通りました。。。

migration-1        | [INFO  wait] Host [db:3306] is now available!
migration-1        | [INFO  wait] --------------------------------------------------------
migration-1        | [INFO  wait] docker-compose-wait - Everything's fine, the application can now start!
migration-1        | [INFO  wait] --------------------------------------------------------
migration-1        | INFO  [alembic.runtime.migration] Context impl MySQLImpl.
migration-1        | INFO  [alembic.runtime.migration] Will assume non-transactional DDL.
migration-1        | INFO  [alembic.runtime.migration] Running upgrade  -> 61e1a7eba0f8, create_table_circle_info
migration-1        | run migraiton scripts in online mode
migration-1 exited with code 0

恥ずかしながら、OSによって改行コードが異なることを認知していませんでした。。。それが原因でfile not found errorが発生するとは、それはそれで不思議ですね。

[参考]
https://qiita.com/sbeleg_77/items/833de09f7bca24bc8ab8