はじめに

先ほどVirtualBox 4.3がリリースされました。
http://www.oracle.com/us/corporate/press/2033376

~~ですがまだ vagrant が 4.3 に対応していないので以下のようなエラーが表示され動きません。~~

10/16 8:26 追記ここから
Virtualbox 4.3 に対応したバージョンが出ました。 → http://downloads.vagrantup.com/tags/v1.3.5
10/16 8:26 追記ここまで

Vagrant has detected that you have a version of VirtualBox installed
that is not supported. Please install one of the supported versions
listed below to use Vagrant:

4.0, 4.1, 4.2

そこでコマンドから既存のVMを操作する方法を。（ちなみにVirutalbox限定）

VM 一覧で vmname もしくは uuid を確認。

まずはVMの一覧から vmname もしくは uuid を確認します。

VBoxManage list vms

実行すると以下のような感じで出力されます。

"wheezy64" {ec1a8357-f4ae-4463-bdfc-5fff34bc054c}
"web_default_1378518607" {7a6e33a4-b34b-4ed3-8b77-2e4ff86fdb04}
"wp_default_1381838856" {45537216-ad10-4460-93d7-4a19d45732c9}

このうち、 "web_default_1378518607" が vmname で、{7a6e33a4-b34b-4ed3-8b77-2e4ff86fdb04} が uuid です。

ヘッドレスでVMを起動する

画面を伴わない方法で起動したいので、--type headless オプションを追加して起動します。上記のコマンドで取得した vmname もしくは uuid を指定してください。

VBoxManage startvm {vmname|uuid} --type headless

SSHでつなげる

あとは以下の要領でSSHに繋げられらはず。

ssh localhost -p 2222 -l vagrant

その他

その他、使えそうな主なコマンドは以下の通りです。

電源 Off

VBoxManage controlvm {vmname|uuid} poweroff

一時停止

VBoxManage controlvm {vmname|uuid} pause

再開

VBoxManage controlvm {vmname|uuid} resume

多分このくらいあれば問題ないと思いますので、対応されるまでどうぞです。
ちなみに vagrant で設定していたポート転送などについては、そのまま使えていますが、環境によっては使えないかもしれません。