Railsチュートリアルを終えたので、学んだことを整理していきたいと思います。
##ディレクトリ構成
よく使うファイル、ディレクトリだけを抜粋します。

app
 ├── assets/         # 画像ファイル、CSS、Javarcriptなど
 ├── controllers/    # コントローラー
 ├── helpers/        # ヘルパー関数
 ├── mailers/        # メール送信の設定
 ├── models/         # DBの各テーブルに紐づいた設定（関数、バリデーションなど）
 ├── uploaders/      # ファイルアップロード周りの設定
 ├── views/          # ビューファイル
config
 ├── routes.rb       # ルーティングの設定
db
 ├── migrate/        # DBの構成変更に関するファイル
 ├── seeds.rb        # DBに入れるデータ
public/              # 404エラーページなど
test
 ├── controllers/    # コントローラーのテスト
 ├── fixtures/       # テスト用のサンプルデータ
 ├── helpers/        # ?
 ├── integration/    # 統合テスト
 ├── mailers/        # メイラーのテスト
 ├── models/         # モデルのテスト
 ├── test_helper.rb  # テスト用のヘルパー関数
Gemfile              # 使いたいGemのリスト
Gemfile.lock         # Gemを使うための記述

##コマンド
####プロジェクトを作成
rails new {プロジェクト名}

$ rails new sample_app

####ローカルサーバーを起動

$ rails s

####Railsコンソールを起動
Railsコンソールを使うことで、現在の設定（関数、データベース、gemなど）を引き継いだ状態でRubyのコードを実行することができます。

$ rails c
$ rails c --sandbox #コンソールでの実行内容をDB等に反映しない

####テストを実行

$ rails t

####コントローラーを作成
rails g {コントローラー名} {アクション名}
コントローラー名は頭文字大文字の複数形

$ rails g controller Users
$ rails g controller Users new show index #中身が空の「new,show,index」アクションを生成

作られるファイル
controller、view、test/controllers、test/helpers、scss、js

####モデルを作成
rails g model {モデル名} {カラム名:型}
モデル名は頭文字大文字の単数形
新規テーブルを作成する時に使います。

$ rails g model User name:string age:integer

作られるファイル
migration、model、test/model、test/fixture

####マイグレーションファイルを作成
rails g migration {マイグレーションファイル名}
既存テーブルの構造を変更したい時（カラムの追加など）に使います。
マイグレーションファイル名は、作成目的がわかるように命名します。

$ rails g migration AddNicknameToUser

作れられるファイル
migration

カラム追加、カラム削除、テーブル作成を行う場合には、以下のようなマイグレーションファイル名をつけると、必要なコードが途中まで書かれている状態でファイルが作成されます。

変更内容	マイグレーションファイル名
カラム追加	Addカラム名Toテーブル名
カラム削除	Removeカラム名Fromテーブル名
テーブル作成	Createテーブル名

####マイグレーションファイルを適用

$ rails db:migrate

####適用したマイグレーションをロールバック

$ rails db:rollback

####統合テスト用ファイルを作成
rails g integration_test {ファイル名}

$ rails g integration_test users_login_test

####gemをインストール
Gemfileに記述したgemをインストールします。

$ bundle install

##参考
Rails generate の使い方とコントローラーやモデルの命名規則
 【Rails】マイグレーションファイルを徹底解説！