MacのSafariを完全に初期状態にする方法

Webサイトのキャッシュを消す

/Users/user-name/Library/Containers/com.apple.Safari

com.apple.Safariの部分は表示がSafariとかになってたりしますが、Safariっぽいやつを削除してください。

Safari自体のキャッシュを消す

/Users/user-name/Library/Safari

Appcleanerで他のキャッシュも消せます。
一度Safariをウインドウにぶち込んで、キャッシュデータだけ選択して削除しましょう。
間違えてもSafari自体は削除しないように。