フレームワーク：Spring Boot
ビルドツール：Maven
という構成で、mvn installでjarを作成したとする。

このjarはどういう構成になっているのか？

jarは内部的にはzipなので、拡張子をzipに変更して解凍して確認してみた。

jar（zip）のルートディレクトリ
├─BOOT-INF
│  ├─classes
│  │  ├─com
│  │  │  └─example
│  │  │      └─[artifactId]
│  │  │          ├─controller
│  │  │          ├─dto
│  │  │          ├─mapper
│  │  │          ├─model
│  │  │          └─service
│  │  ├─static
│  │  └─templates
│  └─lib
├─META-INF
│  └─maven
│      └─com.example
│          └─[artifactId]
└─org
    └─springframework
        └─boot
            └─loader
                ├─archive
                ├─data
                ├─jar
                ├─jarmode
                └─util

ということで、Spring Bootで自作で組んだプログラムは、BOOT-INF\classes配下に格納される。
Tomcatを内包する実行可能jar（Fat jar）である。

Spring Boot使わないMavenプロジェクトの場合

Spring Boot使わないpureなJavaのMavenプロジェクトの場合はこのように簡素な構造になる。

jar（zip）のルートディレクトリ
├─com
│  └─example
│      ├─dto
│      └─enums
└─META-INF
    └─maven
        └─com.example
            └─demo

他Mavenプロジェクトのpom.xmlに依存関係を追加して
import com.example.enums.Foo;
という形で参照することができる。

MANIFEST.MFについて

META-INFディレクトリ内に、MANIFEST.MFというファイルが存在する。
これはマニフェストファイルといい、jarファイルについての説明が記載されたテキストファイルであり、jarファイル作成時に自動生成される。
実行時にmain()メソッドを呼び出すクラスや、クラスパスの定義がある。

下記はその一例である。

SpringBootプロジェクトの場合の一例

Manifest-Version: 1.0
Created-By: Maven JAR Plugin 3.3.0
Build-Jdk-Spec: 17
Implementation-Title: springTest
Implementation-Version: 0.0.1-SNAPSHOT
Main-Class: org.springframework.boot.loader.JarLauncher
Start-Class: com.example.springTest.SpringTestApplication
Spring-Boot-Version: 3.0.5
Spring-Boot-Classes: BOOT-INF/classes/
Spring-Boot-Lib: BOOT-INF/lib/
Spring-Boot-Classpath-Index: BOOT-INF/classpath.idx
Spring-Boot-Layers-Index: BOOT-INF/layers.idx

Spring Boot使わないMavenプロジェクトの場合の一例

Manifest-Version: 1.0
Created-By: Apache Maven 3.8.7
Built-By: circu
Build-Jdk: 17.0.5

マニフェストファイルが壊れたりしていると、jar起動したときに、
「アプリ名.jarにメイン・マニフェスト属性がありません」というエラーが出ることが考えられる。
これについては詳しくは、Spring Boot jarにメイン・マニフェスト属性がありませんを解決する方法を参照。