ほぼ自分めもです。

Mroongaのデータベースが壊れた

ERROR 1016 (HY000): mroonga: failed to open table xxxxxxx

restoreを試みるも失敗

mysql -u root -p xxxxxx< mysql_bkup.sql

ERROR 1016 (HY000) at line 36: grn_io_lock failed

データディレクトリを削除して一から構築し直し

データディレクトリ一旦削除

rm -rF /var/lib/mysql/{database}

アンインストール

-　ライブラリを調べる

$ yum list installed |grep -i "mysql"
Repodata is over 2 weeks old. Install yum-cron? Or run: yum makecache fast
groonga-normalizer-mysql.x86_64      1.1.1-1.el7.centos              @groonga
mysql-community-client.x86_64        5.7.18-1.el7                    @mysql57-community
mysql-community-common.x86_64        5.7.18-1.el7                    @mysql57-community
mysql-community-libs.x86_64          5.7.18-1.el7                    @mysql57-community
mysql-community-libs-compat.x86_64   5.7.18-1.el7                    @mysql57-community
mysql-community-release.noarch       el7-7                           installed
mysql-community-server.x86_64        5.7.18-1.el7                    @mysql57-community
mysql57-community-mroonga.x86_64     7.02-1.el7.centos               @groonga
php-mysqlnd.x86_64                   7.1.5-1.el7.remi                @remi-php71

MySQLを停止させてから

$ sudo systemctl stop mysqld

全てアンインストール

$ sudo yum remove xxxxxxx

再度インストール

構築時の手順に従ってインストール

2.5. CentOS — Mroonga v7.08 documentation

パスワードの確認

$tmp_password=$(sudo grep 'A temporary password' /var/log/mysqld.log | sed -e 's/^.*: //')
$ echo $tmp_password
A8<g2!3%=rry

ログインしてからパスワードは変更すること

バックアップデータをrestoreして終了

mysql -u root -p xxxxxxxxx< mysql_bkup.sql

バックアップ大事