最新の論文を手に入れて世界の最前線を知る
研究において常に最新情報を逃さず、関連分野で新しくpublishされる論文に常に気を配ることは大切です。
- 自分の行っている研究について、今世界ではどんなことが分かっているのか、はたまた分かっていないのか
- 自分の関連分野のトレンドはどうなっているか
- ラボでのジャーナルクラブで紹介する論文の良いネタはないか
どれも気になる事柄だと思います。
とはいえ、毎日論文検索で関連ワードを検索するのも面倒です。
ここでは、生物学の論文検索に特化した内容を紹介します。
NCBIのPubMedおよびbioRxivの新着論文アラート機能を使って、自分の興味ある論文がpublishあるいはsubmitされたらメールで通知を受け取れるように設定します。
NCBI PubMed
NCBI PubMedとは？
そもそもこのページにたどり着いた皆さんならご存知でしょう。語らずもがな。省略。
アカウントの設定
まずNCBIでアカウントを取得します。NCBIトップページ右上の"Sign in to NCBI"もしくはPubMedトップページ右上の"Log in"から行います。
NIHやNCBIのアカウントを取得しても良いですし、Googleアカウントを利用して取得することも可能です。
検索キーワード登録
一度いつも通りの手順で、PubMedで登録したキーワードを使って検索します。検索結果表示後、検索窓の下に"Create alert"があるので、それをクリックします。
検索方法などの設定ページに移動するので、適宜設定を変更します。
検索設定
Name of saved search: NCBIのマイページに表示される設定名
Search terms: PubMedの検索窓に書き込む検索ワードをここに入力します。例えば、"(human) AND disease"とか。
Would you like email updates of new search results?: Yesの一択です。
Email: 通知を受け取るメールアドレス
Frequency: どのくらいの頻度で受け取るか変更できます。自分の関連研究はそこまで活発ではないので"Daily"に設定してあります。
Report format: 受け取り時のフォーマットを変えられます。自分はデフォルトのSummaryしか試したことはありませんが、論文タイトル・著者・雑誌社名が書かれているのでこれで十分かと思います。
Send at most: これは多めに設定して損はないのではないでしょうか？
Send even when there aren't any new results: うるさいだけなので外しておきましょう
Optional text in email: よくわかりません
これで設定は完了です。
自分の場合だけかもしれませんが、平日は毎日20時頃にメールが届きます。休日は朝方に届く時もあります。
「この著者の論文だけ知りたい！」「この雑誌社からpublishされる論文だけ知らせてほしい！」という場合、PubMedにはAdvanced検索が備わっています。Advanced検索で条件を絞り込んだ後、Cleate alertで追加するか、検索フレーズを丸ごとコピーして"Search terms"に貼り付けてください。例えば、"AND ("Nature"[Journal]) "と加えれば、Natureからpublishされた論文のみを絞り込むことができたりします。
bioRxivでの設定
bioRxivとは
bioRxiv（バイオアーカイヴ）は2013年11月に開始された生物学のプレプリントリポジトリである。正式な表記はbioRχivで、χはエックスではなくギリシャ文字のχ（カイ）である。コールド・スプリング・ハーバー研究所 (Cold Spring Harbor Laboratory, CSHL) が運営している。プレプリントであるので、bioRχivが提供する論文は査読されていない。しかし基本的な選別と剽窃の判別は行われている。読者はプレプリント論文にコメントを付けることができる。
Wikipwdiaより転載。つまり査読前のpreprintのpaperが読めるサイトです。PubMedは査読つきでacceptされた論文しか検索・閲覧することができません。一方で、bioRxivは論文がreviewに回った段階でauthorがbioRxivに登録さえされていれば閲覧することが可能です。
設定
https://www.biorxiv.org/alerts
ALERTSのページから設定ができます。まず、アラートを受け取るメールアドレスを登録します。
その後、ADD NEW ALERTS > Add a new Keyword/Author Alert から自分の検索する検索ワードを登録して設定を完了させてください。
注意!
このアドレス入力はPubMedのようにアカウントを作るものではない上に、後で修正が効かないのでミスなく入力してください。自分は後日メールアドレスの誤入力に気付き1週間ほどメールを受け取り損ねました。
よい研究ライフを。