R-3.6.2にMonocle3を導入

Monocle3をR3.6.2に導入

MacOS 10.14.6
R 3.6.2
Bioconductor導入済み

準備：gdalをインストールしておく

sfの導入に必要なのでターミナルでgdalを導入
brew使える環境なら以下のコマンドでok（と思う）

ターミナルでインストール

brew install pkg-config
brew install gdal

R上でインストール

install.packages("devtools")
devtools::install_github('cole-trapnell-lab/leidenbase')
devtools::install_github('cvarrichio/Matrix.utils')
install.packages("sf", dependencies = TRUE)
devtools::install_github('cole-trapnell-lab/monocle3')

動作確認

Rのセッション上で動作確認

library(monocle3)

動いた。