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Seuratでプロット(Dimensional reduction plot)を表示する

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Summary

DimPlot(seurat_object)

準備

こちらで基本的な計算ができたら、次は結果を表示しましょう。
一番基本的な結果は、細胞がどのようにクラスタリングされたかを示す散布図だと思います。それはSeuratDimPlotというコマンドを使用します。
まずはRでSeuratを呼び込みます。すでにされている方は不要です。

library(Seurat)

基本的な図

DimPlot(seurat_object)

image.png

# 色分けの種類を変えたいとき
デフォルトはSeurat clustersになっています。

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