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n個以上欠損値があるカラム(列)を削除

Last updated at Posted at 2022-12-19

概要

pandasのデータフレームで欠損値がn個以上あるカラム(列)を削除したい場合の方法。

データを用意

import numpy as np
import pandas as pd

data_path = "path/train.csv"
df = pd.read_csv(data_path)

方法1

dropna()を使う方法。
dropna()は欠損値ではない要素の数がn個以上ある列(行)を残し、それ以外の列(行)を削除する。
よって、欠損値がn個以上ある列を削除したい場合は、行数を取得して、(行数-n)をdropnaに渡してやれば良い。
以下は、n=5の場合。

n_samples = len(df)
n_thresh = n_samples - 5  # 行数 - n
df_null_rm = df.dropna(thresh=n_thresh, axis=1)

方法2

各列の欠損数を算出して、欠損数がn個より少ない列だけ抜き出す方法。
isnull()で欠損値か判定し、sum()で列ごとの欠損数を算出する。
各列の欠損数がn個より少ないかどうかを示すブール型のSeries(もしくはリスト)を算出し、locで抜き出す。
以下は、n=5の場合。

df_null_rm = df.loc[:, df.isnull().sum()<5]

もしくは、リストを使いたい場合は、

df_null_rm = df.loc[:, list(df.isnull().sum()<5)]
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