VirtualboxとかでもubuntuのDesktop版を利用する人は、やったほうがいいと思います。
左上のアクティビティをクリックし「ソフトウェア」とか「software」と検索する。
ソフトウェアのアップデートがでる。（ダンボールみたいなアイコンのやつを実行する。）
画面のようにアップデートタブで、アップデートの自動確認を「なし」にしてあげる。
これだけです。
アップデートしたいときはコンソール（ターミナル）で
apt update
apt upgrade
してやればいいです。
GUIだと進捗がわかりにくいので、こっちのほうがやりやすいですね。
他のメニューもダウンロードさせたりしないように、
「表示する」というふうにしておけば勝手にアップデートプロセスが走らないです。
しばらくOSを起動しないと、勝手にアップデートプロセスが走り出して、勝手にCPU食いつぶすからやったほうがいいです。
しかもシングルコア。。。
こういうOSはCLIが良いんだから、。
ServerだとGUIもないし、自動アップデートも標準でOFFになってるみたいなので、悩みませんが、普段遣いしてるとうっとおしいですね。