原因
/Users/ユーザー名/.local/lib/python3.5/site-packages/homebrew.pth
内に
import site; site.addsitedir("/usr/local/lib/python2.7/site-packages")
と,python2.7のsite-packagesが入っていた。
そのため,python3スクリプト内で一部ライブラリをimportしようとした際にpython2.7版がインポートされようとし,エラーが出ていた。
対処
import site; site.addsitedir("/usr/local/lib/python3.5/site-packages")
と書き換える。