0
1

Delete article

Deleted articles cannot be recovered.

Draft of this article would be also deleted.

Are you sure you want to delete this article?

More than 3 years have passed since last update.

Asperaを使って遺伝研スパコンにファイルを転送する。(windows)

Last updated at Posted at 2020-10-29

#はじめに
大規模シーケンスデータ(200GB)をAsperaを使って遺伝研の自分のフォルダへ転送しとしたところ、少しつまずいたので備忘録的に残しておきます。コマンドはwindows PowerShellでうちました。

#秘密鍵ファイルの準備
基本的には
遺伝研の利用ガイド
に沿ってやっていきます。しかし、Aspera CLI ダウンロード→パスを通した後、

$ ascp -l 1G -Z 1500 -P 33001 -i (秘密鍵ファイル名) (送りたいファイル) ユーザーID@ascp.ddbj.nig.ac.jp:(指定ディレクトリ)

となっていますが、利用ガイド通りに秘密鍵ファイル(id_sra)を指定すると、パスフレーズ入力後にエラーがでます。

ユーザーガイド
を見ると、秘密鍵ファイルの形式が.pem形式でなければならないようです。

#秘密鍵ファイルの変換

このサイトを参考にして、PuTTYgenを使用して.ppkファイルを.pem形式に変換します。

変換がおわったら、(秘密鍵ファイル名)を.pem形式のモノにすれば完了です。

結果は大体178Mb/sで、200GB転送するのに3時間弱かかりました。

0
1
0

Register as a new user and use Qiita more conveniently

  1. You get articles that match your needs
  2. You can efficiently read back useful information
  3. You can use dark theme
What you can do with signing up
0
1

Delete article

Deleted articles cannot be recovered.

Draft of this article would be also deleted.

Are you sure you want to delete this article?