自分用メモ。
TeX で eps のレイアウトが崩れる時の修正法として、 documentclass に dvipdfmx を追加する方法が知られている。
documentclass[dvipdfmx]
Lyx でこれにあたる事をするにはどうすれば良いかというと、 lyx ファイルをテキストエディタか何かで開いて \endpreamble の直下に \options dvipdfmx を追加すれば良い。
#LyX 2.1 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
\lyxformat 474
\begin_document
\begin_header
\textclass extbook
\begin_preamble
\usepackage{amsmath}
\end_preamble
\options dvipdfmx
この状態で「ファイル」「書き出し」「pLateX」を実行すると documentclass に dvipdfmx が追加された。