[備忘録][随時更新]RのDataFrame操作でよく使う書き方まとめ

しょっちゅうググってるやつを自分用にまとめる。

文字列の連結

参考に従い、+ 演算子を書き換える
やや裏技っぽい方法だけど便利。

"+" <- function(e1, e2) {
    if (is.character(c(e1, e2))) {
        paste(e1, e2, sep = "")
    } else {
        base::"+"(e1, e2)
    }
}

最初のカラムをindexにして削除

rownames(df) <- df[,1]
df <- df[,-1]

sumを取る

df_sum <- apply(df,2,sum)

これだけだと戻り値がvectorなため、必要に応じ以下のようにdataframeに変換。

df_sum <- data.frame(apply(df,2,sum))
colnames(df_sum) <- c("sum")
df_sum <- t(df_sum)

rowの名前で削除

names <- c('rowA','rowB')
df <- df[!(row.names(df) %in% names), ]

rowの名前で取り出し

names <- c('rowA','rowB')
df <- df[names, ]

空のDataFrame作成

df <- data.frame(
    abundance=double(),
    taxon=character(), 
    sampleID=character(), 
    depth=character(), 
    station_id=character(), 
    stringsAsFactors=FALSE
) 

left_join

dplyr::left_join(df1 ,df2, by = "key")

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