今の所、困っていることは（PCが古くて万事が重たいこと以外）ないのだが、一応、メモを取っておく。
- pip3 を apt-get でinstall する。
- pip3 で必要なpython3 のモジュールをインストールする。
- numpy, pandas, statsmodels, sci
備忘録として、
- pip3 はsudo で実行したが、sudo -H で実行したほうが良いという警告メッセージが出た。
今後はそうしよう。~/.cache/pip の権限がない、ということらしい。 - statsmodel は最初にpip3 install しただけだと関連するライブラリがproperly にinstall されなかったらしい。
ので、再度、pip3 install -U したところ、何かがインストールされ、無事に動くようになった。症状としては、これと同じだった。
$ sudo apt-get install python3-pip
$ sudo -H pip3 install pandas
$ sudo -H pip3 install statsmodels
$ sudo -H pip3 install -U statsmodels
特に意味はないが、実行時のメッセージも一部コピペしておく。
$ sudo apt-get install python3-pip
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています
状態情報を読み取っています... 完了
以下のパッケージが自動でインストールされましたが、もう必要とされていません:
libconsole-bridge-dev libconsole-bridge0.4 liburdfdom-dev liburdfdom-headers-dev liburdfdom-model liburdfdom-model-state liburdfdom-sensor liburdfdom-world
これを削除するには 'sudo apt autoremove' を利用してください。
以下の追加パッケージがインストールされます:
python-pip-whl python3-setuptools python3-wheel
提案パッケージ:
python-setuptools-doc
以下のパッケージが新たにインストールされます:
python-pip-whl python3-pip python3-setuptools python3-wheel
アップグレード: 0 個、新規インストール: 4 個、削除: 0 個、保留: 7 個。
2,050 kB のアーカイブを取得する必要があります。
この操作後に追加で 3,928 kB のディスク容量が消費されます。
続行しますか? [Y/n]
取得:1 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic-updates/universe amd64 python-pip-whl all 9.0.1-2.3~ubuntu1 [1,652 kB]
取得:2 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic-updates/universe amd64 python3-pip all 9.0.1-2.3~ubuntu1 [114 kB]
取得:3 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic/main amd64 python3-setuptools all 39.0.1-2 [248 kB]
取得:4 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu bionic/universe amd64 python3-wheel all 0.30.0-0.2 [36.5 kB]
2,050 kB を 9秒 で取得しました (225 kB/s)
以前に未選択のパッケージ python-pip-whl を選択しています。
(データベースを読み込んでいます ... 現在 205501 個のファイルとディレクトリがインストールされています。)
.../python-pip-whl_9.0.1-2.3~ubuntu1_all.deb を展開する準備をしています ...
python-pip-whl (9.0.1-2.3~ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ python3-pip を選択しています。
.../python3-pip_9.0.1-2.3~ubuntu1_all.deb を展開する準備をしています ...
python3-pip (9.0.1-2.3~ubuntu1) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ python3-setuptools を選択しています。
.../python3-setuptools_39.0.1-2_all.deb を展開する準備をしています ...
python3-setuptools (39.0.1-2) を展開しています...
以前に未選択のパッケージ python3-wheel を選択しています。
.../python3-wheel_0.30.0-0.2_all.deb を展開する準備をしています ...
python3-wheel (0.30.0-0.2) を展開しています...
python-pip-whl (9.0.1-2.3~ubuntu1) を設定しています ...
python3-wheel (0.30.0-0.2) を設定しています ...
python3-pip (9.0.1-2.3~ubuntu1) を設定しています ...
man-db (2.8.3-2) のトリガを処理しています ...
python3-setuptools (39.0.1-2) を設定しています ...
$ sudo -H pip3 install pandas
$ sudo -H pip3 install statsmodel
$ sudo -H pip3 install statsmodels
Collecting statsmodels
Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/85/d1/69ee7e757f657e7f527cbf500ec2d295396e5bcec873cf4eb68962c41024/statsmodels-0.9.0-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl (7.4MB)
100% |████████████████████████████████| 7.4MB 26kB/s
Requirement already satisfied: pandas in /usr/local/lib/python3.6/dist-packages (from statsmodels)
Collecting patsy (from statsmodels)
Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/5d/eb/92c4b45ca47a2dd1339c958636e083b50ffadb5162a599a1cbbe92f89832/patsy-0.5.0-py2.py3-none-any.whl (232kB)
100% |████████████████████████████████| 235kB 494kB/s
Requirement already satisfied: python-dateutil>=2.5.0 in /usr/local/lib/python3.6/dist-packages (from pandas->statsmodels)
Requirement already satisfied: pytz>=2011k in /usr/lib/python3/dist-packages (from pandas->statsmodels)
Requirement already satisfied: numpy>=1.9.0 in /usr/lib/python3/dist-packages (from pandas->statsmodels)
Requirement already satisfied: six in /usr/lib/python3/dist-packages (from patsy->statsmodels)
Installing collected packages: patsy, statsmodels
Successfully installed patsy-0.5.0 statsmodels-0.9.0
$ sudo -H pip3 install scipy
Collecting scipy
Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/a8/0b/f163da98d3a01b3e0ef1cab8dd2123c34aee2bafbb1c5bffa354cc8a1730/scipy-1.1.0-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl (31.2MB)
100% |████████████████████████████████| 31.2MB 13kB/s
Requirement already satisfied: numpy>=1.8.2 in /usr/lib/python3/dist-packages (from scipy)
Installing collected packages: scipy
Successfully installed scipy-1.1.0
$ sudo -H pip3 install -U statsmodels
Requirement already up-to-date: statsmodels in /usr/local/lib/python3.6/dist-packages
Requirement already up-to-date: patsy in /usr/local/lib/python3.6/dist-packages (from statsmodels)
Requirement already up-to-date: pandas in /usr/local/lib/python3.6/dist-packages (from statsmodels)
Requirement already up-to-date: six in /usr/lib/python3/dist-packages (from patsy->statsmodels)
Collecting numpy>=1.4 (from patsy->statsmodels)
Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/22/02/bae88c4aaea4256d890adbf3f7cf33e59a443f9985cf91cd08a35656676a/numpy-1.15.2-cp36-cp36m-manylinux1_x86_64.whl (13.9MB)
100% |████████████████████████████████| 13.9MB 20kB/s
Collecting pytz>=2011k (from pandas->statsmodels)
Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/30/4e/27c34b62430286c6d59177a0842ed90dc789ce5d1ed740887653b898779a/pytz-2018.5-py2.py3-none-any.whl (510kB)
100% |████████████████████████████████| 512kB 985kB/s
Requirement already up-to-date: python-dateutil>=2.5.0 in /usr/local/lib/python3.6/dist-packages (from pandas->statsmodels)
Installing collected packages: numpy, pytz
Found existing installation: numpy 1.13.3
Not uninstalling numpy at /usr/lib/python3/dist-packages, outside environment /usr
Found existing installation: pytz 2018.3
Not uninstalling pytz at /usr/lib/python3/dist-packages, outside environment /usr
Successfully installed numpy-1.15.2 pytz-2018.5