Gnu Global で、htags -ansxf で生成する html ファイルには charaset の meta タグがないので、元のソースファイルに UTF-8 以外の文字コード系（例えば SJISなど）でコメントが記載されていると文字化けします。
そんな時は、htags が生成した HTML フォルダ配下の全 .html ファイルに（例えばタイトルタグの閉じタグの直後とかに）以下のように charset の meta タグを書いてしまえば正しく表示される HTML になります
# Mac の場合
find . -name "*.html" | xargs sed -i "" 's#</title>#</title><meta charset="shift_jis">#g'
# Mac 以外
find . -name "*.html" | xargs sed -i 's#</title>#</title><meta charset="shift_jis">#g'
Mac の sed は -i オプション（上書き変更オプション）の後に "" をつけてあげないと invalid command code というエラーになります