しょうもないことですが、調べても前例が出てこなかったので備忘録として。

##sublime text 3でpackage controlが動かない
・package controlが入ってることは確認できた
・エディタ自体をインストールし直したりなどもしてみたが変わらず
※windows端末

##ユーザー設定でignoreされていた
基本設定→基本設定-ユーザ
で設定ファイルを覗いてみると、

{
	"color_scheme": "Packages/User/SublimeLinter/Monokai (SL).tmTheme",
	"font_size": 12,
	"ignored_packages":
	[
        "Package Control",
		"Vintage"
	]
}

上記のようになっていました。
Package Controlの記述を消してみると、あっさり解決。
この設定した人は後で職員室にきてほしい。

##まとめ
普段使いしていないエディタとはいえ、最低限の設定は知っておきたいと思いました…