うまく行ったのになぜかアセったRStudio Serverのインストール

経緯･目的

目的

• UbuntuにRStudio Serverをインストールする際に､惑わされやすいポイントの共有
  • インストール先は､WSL2のUbuntuですが､惑わされるポイントはほぼ同じになると思ってます

経緯

• Windows10Proにデータ分析用のR環境を構築中
• 慣れや文字化けの問題､そしてWSL2に導入済みのJupyter Labから同じRを使いたいので､RStudio ServerをWSL2にインストールすることにした
• 基本的には公式ドキュメント通りにやってうまく行ったが､エラーメッセージに色々と困らされて時間を使ってしまった
  • 重要そうなので入念に調べたら､無視していいエラーメッセージだった
  • エラーメッセージが出ると思ってたら､何も出なかった
• エラーメッセージについては､公式ドキュメントでも補足されてるが､見落としてしまったので強調する意味で共有する

インストール

環境

• Ubuntu 20.04 (WSL2 in Windows 10 Pro)

手順

• 基本は､Using RStudio Server in Windows WSL2(2021/10/5,RStudio Support)のRStudio Server Setup通り
• キーの取得などは､Ubuntu Packages For R - Brief Instructions(CNAN)を参考にした
• 引っかかったポイントは後述
• 問題ないことを確認するために､whichなどを使いつつ､都度確認しながら進めた
  • この方法も後述

bash

## Step1: aptのアップデート
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade -y

## Step2: 最新のRの取得 
### キーがあることを確認する
gpg --show-keys /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc
### キーの取得
wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc

### apt credentialの追加
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/Linux/ubuntu focal-cran40/'

## Step3: Rと､RStudio Serverのインストールに必要なものをインストールする 
sudo apt install -y r-base r-base-core r-recommended r-base-dev gdebi-core build-essential libcurl4-gnutls-dev libxml2-dev libssl-dev

## Step4: 最新のRStudio Serverをインストールする
wget https://rstudio.org/download/latest/stable/server/bionic/rstudio-server-latest-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-latest-amd64.deb

## Step5: RStudio Serverの起動
sudo rstudio-server start

## Step6: ブラウザからアクセスする
# デフォルトのURL: http://localhost:8787
# デフォルトのログイン情報
# ユーザ名: Ubuntuのroot権限のユーザ名
# パスワード: Ubuntuのroot権限のパスワード

引っかかったポイント

紛らわしいエラーメッセージが出て､成功しているのに､失敗したと勘違いした

Step2: 最新のRの取得

• sudo add-apt-repository...の実行後のエラーメッセージ

E: The repository 'https://cloud.r-project.org/bin/Linux/ubuntu focal-cran40/ Release' does not have a Release file.
N: Updating from such a repository can't be done securely, and is therefore disabled by default.
N: See apt-secure(8) manpage for repository creation and user configuration details.

• 色々検索して調べてみたが､エラーメッセージが出た理由は不明です
  • 無視してStep3に進んでみたところ､Rのインストールが始まり､完了しました
  • Rのコンソール画面が立ちあがったので､インストールにも成功したと思ってます

※詳しい方､つっこみや解説頂けると嬉しいです

Step4:　最新のRStudio Serverのインストール

• sudo gdebi rstudio-server-latest-amd64.deb実行後のエラーメッセージ

Couldn’t find an alternative telinit implementation to spawn.

→RStudio Supprt のドキュメントを見ると､｢気にしなくていい｣と書かれてるので､無視してかまいません

Note1: You may receive a warning message like “Couldn’t find an alternative telinit implementation to spawn.” This is a known issue and can be safely ignored.
Using RStudio Server in Windows WSL2(2021/10/5,RStudio Support)

Step5: RStudio Serverの起動

• エラーメッセージが表示されなければ成功です

Note1: If there was no error message, you can assume that your RStudio Server has been successfully loaded.
Using RStudio Server in Windows WSL2(2021/10/5,RStudio Support)

その他

各ステップがうまく行ったかを確認する方法

• うまく行ったかを明示的に確認する方法
• あったほうが安心できると思うので共有します

キーがあるか確認する方法

• 以下のコマンドを入力して結果を確認する

bash

gpg --show-keys /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc

参考　Ubuntu Packages For R - Brief Instructions(CNAN)

• キーがあると､こんな感じ
  

• キーがないと､こんな感じ
  

キーの取得方法

• 最初はキーがないことに気がつかず､Step2の最後まで進めてしまう
• 怪しいのエラーメッセージについて調べているときに､キーがないことに気がついて取得しなおしている

bash

wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc

参考　Ubuntu Packages For R - Brief Instructions(CNAN)

Rがインストールできたことを確認する方法

• which Rで確認する
  • うまく行っていれば､/usr/bin/Rと表示される
• Rで確認する
  • うまく行っていれば､おなじみのRコンソールが表示される

RStudioがインストールできたことを確認する方法

• which rstudio-serverで確認する
  • うまく行っていれば､/usr/bin/rstudio-serverと表示される
• Step6ができることを確認する

今後の課題

apt credencial

何なのか分かってないので､きちんとしらべようと思います｡